아 제가 제대로 읽지 않았습니다. 제 답변은 일본어폰트가 아예 없다는 가정이구요.
일본어 폰트가 있는데도 나오지 않는다면 보기 메뉴에서 문자 인코딩을 바꿔 보세요.
기본이 EUC-JP 일텐데 보기메뉴-문자 인코딩-자세히-동아시아어 - 일본어(Shift_JIS)로 바꾸시면 일본어 사이트 대부분은 나올 것입니다. 글자가 안 나오면 다른 것으로도 바꿔 보시구요. 그럼 즐거운 하루되세요.^^
위의 증상만으로는 인코딩을 잘못 설정 (EUC-JP vs Shift_JIS. 드물긴 하지만, 웹 페이지에서도 ISO-2022-JP를 쓴 경우도 있지만, 이번 경우는 그것은 아니고요)한 것인지 글꼴이 없어서인지 알 수 없습니다. 왜냐하면 한국어 글꼴에 웬만한 글자는 들어 있거든요. 일본식 약자 가운데 안 들어 있는 것이 좀 있어서 그것들만 물음표로 나올 수 있습니다. 하지만, 이 경우는 인코딩 잘못 설정일 확률이 더 높긴 하네요. MS IE에서는 아마 잘 보고 계셨을 테니까요.